MMUPHin

DOI:10.18129 / B9.bioc.MMUPHin

微生物组研究异质性的统一管道元分析方法

Bioconductor版本:发行版(3.16)

MMUPHin是一个用于微生物组群元分析任务的R包。它具有以下功能接口:a)协变量控制的批和队列效应调整，b)元分析差异丰度测试，c)元分析无监督离散结构(聚类)发现，d)元分析无监督连续结构发现。

作者:马思远

维护者:思源MA 上搜索

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MMUPHin”)

超文本标记语言	R脚本	MMUPHin
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect，宏基因组，微生物组，软件
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.6)
进口	Maaslin2，metafor，fpc，igraph，ggplot2，dplyr，tidyr，stringr，cowplot， utils, stats, grDevices
链接
建议	testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown，magrittr，素食主义者，phyloseq，curatedMetagenomicData，genefilter
SystemRequirements	GLPK (>= 4.57)
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	MMUPHin_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	MMUPHin_1.12.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	MMUPHin_1.12.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	MMUPHin_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MMUPHin
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MMUPHin
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MMUPHin/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MMUPHin/
软件包下载报告	下载数据