hdcytodata

doi：10.18129/b9.bioc.hdcytodata

收集生物导体对象格式的高维细胞仪基准数据集

生物导体版本：版本（3.15）

包含一组公开可用的高维细胞仪基准数据集的数据包，格式为SummarizedExperiment和Flowset Bioconductor对象格式，包括所有必需的元数据。行元数据包括样本ID，组ID，患者ID，参考细胞总体或群集标签（如果可用的地方），以及标记“在”单元格中识别“尖峰”的标签（如果可用的地方）。列元数据包括通道名称，蛋白质标记名称和蛋白质标记类（细胞类型或细胞状态）。

作者：Lukas M. Weber [AUT，CRE]，Charlotte Soneson [AUT]

维护人员：lukas M. Weber

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ HDCYTODATA”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ hdcytodata”）

html	R脚本	1. HDCYTODATA软件包
html	R脚本	2.示例和用例
html	R脚本	3.贡献指南
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	实验数据，，，，实验室，，，，表达数据，，，，流环元素数据，，，，homo_sapiens_data，，，，ImmunooncologyData，，，，Singlecelldata
版本	1.16.0
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	实验室，，，，总结性特征，，，，流核
进口	UTILS，方法
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，RTSNE，，，，UMAP，，，，GGPLOT2，，，，流动，，，，mclust
系统要求
增强
URL	https://github.com/lmweber/hdcytodata
BugReports	https://github.com/lmweber/hdcytodata/issues
取决于我	CytofworkFlow
进口我
建议我	diffcyt
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	hdcytodata_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hdcytodata
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/hdcytodata
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/hdcytodata/
软件包下载报告	下载统计