地球

doi：10.18129/b9.bioc.geoquery

从NCBI基因表达综合（GEO）获取数据

生物导体版本：版本（3.15）

NCBI基因表达综合（GEO）是微阵列数据的公共存储库。鉴于该资源的丰富性质和多样性，只想将生物导体工具应用于这些数据是很自然的。地球Query是地理和生物导体之间的桥梁。

作者：肖恩·戴维斯[AUT，CRE]

维护者：sean davis

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ GeoQuery”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Geoquery”）

html	R脚本	使用地球
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	DataImport，，，，微阵列，，，，Onechannel，，，，智者，，，，软件，，，，两通道
版本	2.64.2
在生物导体中	Bioc 1.8（R-2.3）（16年）
执照	麻省理工学院
要看	方法，生物酶
进口	readr（> = 1.3.1），XML2，，，，dplyr，，，，Data.Table，，，，花花公子，，，，马格里特，，，，林玛，，，，卷曲，，，，r.utils
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，生物基因，，，，测试，，，，COVR，，，，降价
系统要求
增强
URL	https://github.com/seandavi/geoqueryhttp://seandavi.github.io/geoquery
BugReports	https://github.com/seandavi/geoquery/issues/new
取决于我	drugvsdisease，，，，染色比例样本，，，，deogetAdb，，，，GSE103322，，，，GSE13015，，，，GSE62944，，，，扫描
进口我	Beadarrayusecases，，，，Bigmelon，，，，Bioplex，，，，chipxpress，，，，coexnet，，，，结论，，，，杂交，，，，葡萄球，，，，埃加德，，，，Gapgom，，，，地理位置，，，，GSE13015，，，，HealthyConcontrolsPreseChecker，，，，Macpet，，，，Minfi，，，，MOONLIGHTR，，，，phantasus，，，，叙事，，，，Sradb
建议我	呼吸道，，，，抗fofilesdata，，，，Aucell，，，，自治，，，，ctsge，，，，dearseq，，，，Debcam，，，，diffcoepp，，，，染料，，，，繁殖，，，，fgsea，，，，GCSSCORE，，，，geneexpressionsignation，，，，Genomicozone，，，，甲基锁，，，，多lust，，，，多胎，，，，muscdata，，，，OMICSPRINT，，，，甲状旁腺，，，，PCATOOLS，，，，ProstateCancerCamcap，，，，Prostatecancergrasso，，，，Prostatecancerstockholm，，，，Prostatecancertaylor，，，，ProstateCancerServarame，，，，Quantiseqr，，，，雷根里奇，，，，regparallel，，，，RGSEA，，，，rnits，，，，runibic，，，，skewr，，，，空间Heatmap，，，，TargetScore，，，，ZFPKM
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	geoquery_2.64.2.tar.gz
Windows二进制	geoquery_2.64.2.zip
MacOS 10.13（高山脉）	geoquery_2.64.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geoquery
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/地球
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/geoquery/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包	来源存档