EBImage

DOI:10.18129 / B9.bioc.EBImage

图像处理和分析工具箱R

Bioconductor版本:发行版(3.16)

EBImage为图像处理和分析提供了通用功能。在基于(高通量)显微镜的细胞分析的背景下,EBImage提供了分割细胞和提取定量细胞描述符的工具。这允许使用R编程语言自动化这些任务,并促进R环境中其他工具的使用,用于信号处理、统计建模、机器学习和图像数据可视化。

作者:Andrzej oleovic, Gregoire Pau, Mike Smith, Oleg Sklyar, Wolfgang Huber, Joseph Barry和Philip A. Marais贡献

维护者:Andrzej oleovich < Andrzej。ole在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“EBImage”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“EBImage”)

超文本标记语言 R脚本 EBImage简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 软件可视化
版本 4.40.0
在Bioconductor BioC 1.8 (R-2.3)(16.5年)
许可证 LGPL
取决于 方法
进口 BiocGenerics(>= 0.7.1),图形,grDevices, stats,abindtiffjpegpnglocfitfftwtools(>= 0.9-7), utils,htmltoolshtmlwidgetsRCurl
链接
建议 BiocStyle消化knitrrmarkdown闪亮的
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/aoles/EBImage
BugReports https://github.com/aoles/EBImage/issues
全靠我 红衣主教CRImagecytomapperDonaPLLP2013FISHalyseRflowcatchRfurrowSegHD2013SGIimageHTSMerfishData
进口我 BioImageDbsbnbc承认flowCHIC的热图imcRtoolssimpleSeg寄居突触山药
建议我 DmelSGIHilbertVis
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 EBImage_4.40.0.tar.gz
Windows二进制 EBImage_4.40.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) EBImage_4.40.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) EBImage_4.40.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBImage
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EBImage
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/EBImage/
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