DegNorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.DegNorm

DegNorm: RNA-seq数据退化归一化

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包在大量RNA-seq数据中执行退化归一化，以提高差异表达分析的准确性。

作者:熊斌，王继平

维护者:Ji-Ping Wang

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DegNorm”)

超文本标记语言	R脚本	DegNorm
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，BatchEffect，报道，DataImport，DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，归一化，质量控制，RNASeq，测序，软件
版本	1.8.2
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	LGPL (>= 3)
取决于	R(>= 4.0.0)，方法
进口	Rcpp(> = 1.0.2中),GenomicFeatures平行,foreach，S4Vectors，doParallel，Rsamtools(> = 1.31.2),GenomicAlignments，的热图，data.table统计数据,ggplot2，GenomicRanges，IRanges，plyr，情节跑龙套,冬青
链接	Rcpp，RcppArmadillo，S4Vectors，IRanges
建议	knitr，rmarkdown，formatR
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/jipingw/DegNorm/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	DegNorm_1.8.2.tar.gz
Windows二进制	DegNorm_1.8.2.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	DegNorm_1.8.2.tgz
macOS二进制文件(arm64)	DegNorm_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DegNorm
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DegNorm
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DegNorm/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/DegNorm/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.16的旧源包	源存档