相机

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAMERA

收集质谱数据注释相关方法

Bioconductor版本:发行版(3.16)

xcms生成的峰值表注释，同位素和加合物的规则注释，同位素验证，未知加合物和片段的EIC相关标记

作者:Carsten Kuhl, Ralf Tautenhahn, Hendrik Treutler, Steffen Neumann {ckuhl|htreutle|sneumann}@ipb-halle.de, rtautenh@scripps.edu

维护者:Steffen Neumann

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“相机”)

PDF		使用compoundQuantiles的原子计数期望
PDF		用CAMERA进行同位素模式验证
PDF	R脚本	利用CAMERA进行分子鉴定
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology，MassSpectrometry，代谢组学，软件
版本	1.54.0
在Bioconductor	BioC 2.4 (R-2.9)(13.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R(>= 3.5.0)，方法，Biobase，xcms(> = 1.13.5)
进口	方法,xcms，RBGL，图，图形，grDevices，统计，utils，Hmisc，igraph
链接
建议	faahKO，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了	Rmpi，雪
URL	http://msbi.ipb-halle.de/msbi/CAMERA/
BugReports	https://github.com/sneumann/CAMERA/issues/new
全靠我	flagme，首次公开募股，LOBSTAHS，MAIT，metaMS，PtH2O2lipids
进口我
建议我	cliqueMS，msPurity，mtbls2，RMassBank
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	CAMERA_1.54.0.tar.gz
Windows二进制	CAMERA_1.54.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	CAMERA_1.54.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	CAMERA_1.54.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAMERA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CAMERA
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/CAMERA/
软件包下载报告	下载数据