BioMM

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioMM

BioMM: Biological-informed多级机器学习框架表型预测使用的组学数据

Bioconductor版本:版本(3.16)

可再生的生物模式的识别从高维组学数据的一个关键因素在理解复杂疾病的生物学或特征。将之前的生物知识纳入机器学习推进这样的研究是一个重要的一步。我们提出了一个生物告诉多级机器学习框架称为BioMM专门为表型预测基于omics-scale数据之前,我们可以评估不同的机器学习模型生物元信息。

作者:Junfang陈和伊曼纽尔施瓦兹

维护人员:陈Junfang < Junfang。在gmail.com chen33 >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BioMM”)

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HTML	R脚本	BioMMtutorial
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文本		新闻

细节

biocViews	分类,去,遗传学,通路,回归,软件
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6)
进口	grDevices统计,跑龙套,晶格,BiocParallel,glmnet,rms,precrec,nsprcomp,管理员,e1071,ggplot2,vioplot,CMplot,成像仪,topGO,xlsx
链接
建议	BiocStyle,knitr,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
建议我
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包档案

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源包	BioMM_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	BioMM_1.14.0.zip
macOS二进制(x86_64)	BioMM_1.14.0.tgz
macOS二进制(arm64)	BioMM_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioMM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BioMM
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/BioMM/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BioMM/
包下载报告	下载数据