AssessORF

DOI:10.18129 / B9.bioc.AssessORF

评估预测使用蛋白质组学和基因进化的保护

Bioconductor版本:版本(3.16)

为了评估质量的一组预测基因的基因组,证据必须首先被映射到基因组。接下来,每个基因都必须分类基于强度的证据支持或反对基因。AssessORF包提供了完成这些任务所需的函数和类结构,使用蛋白质组支安打,进化保存起始密码子作为形式的证据。

作者:Deepank Korandla (aut (cre),埃里克·赖特(aut)

维护人员:Deepank Korandla < dkorandl alumni.cmu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AssessORF”)

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文档

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细节

biocViews	ComparativeGenomics,GenePrediction,遗传学,GenomeAnnotation,蛋白质组学,质量控制,软件,可视化
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0),解读(> = 2.10.0)
进口	Biostrings,GenomicRanges,IRanges,图形,grDevices,方法,属性,跑龙套
链接
建议	AssessORFData,BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	AssessORFData
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	AssessORF_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	AssessORF_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64)	AssessORF_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64)	AssessORF_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AssessORF
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AssessORF
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/AssessORF/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/AssessORF/
包下载报告	下载数据