Brainimager

doi:10.18129/b9.bioc.brainimager

该包适用于生物导体的3.9版;对于稳定的最新版本,请参阅Brainimager

整个神经发育中可视化基因集富集的框架

生物导体版本:3.9

Brainimager是一个软件包,可为用户提供有关其基因集对应于人类大脑的信息。这既可以作为连续变量,又作为易于解释的图像。Brainimager具有额外的功能,可以识别基因表达数据集对应的发育时间的大约何时。与Allen Brain Atlas参考证据相比,评估了空间基因集富集和发育时间预测。

作者:Sara Linker [AUT,CRE]

维护者:sara b链接

引用(从r内,输入引用(“ Brainimager”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ brainimimager”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Brainimager”)

html R脚本 Brainimager
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,遗传,,,,基因烯,,,,软件,,,,转录
版本 1.1.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(1年)
执照 CC BY-SA 4.0
要看 R(> = 3.5)
进口 生物基因,,,,实验室,,,,GGPLOT2,grdevices,网格,栅格, 方法,Randomforest,,,,rcolorbrewer,统计测试
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/saralinker/brainimager
BugReports https://github.com/saralinker/brainimager/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 brainimager_1.1.0.tar.gz
Windows二进制 brainimager_1.1.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) brainimager_1.1.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/brainimager
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/brainimager
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/brainimager/
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