spliceSites

DOI:10.18129 / B9.bioc.spliceSites

该软件包适用于Bioconductor的3.8版本;有关稳定的最新发布版本，请参见spliceSites。

用于从RNA-seq数据中探索排列间隙位置的生物导体包

Bioconductor版本:3.8

对RNA-seq数据进行剪接中心分析。

作者:沃尔夫冈·凯瑟斯

维护者:Wolfgang Kaisers < Kaisers at med.uni-duesseldorf.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本"3.5")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("spliceSites")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“spliceSites”)

PDF	R脚本	spliceSites
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，蛋白质组学，RNAseq，软件
版本	1.30.0
在Bioconductor中	BioC 2.13 (R-3.0)(5.5岁)
许可证	GPL-2
取决于	方法:rbamtools (>= 2.14.3)， refGenome (>= 1.6.0)，Biobase，Biostrings(> = 2.28.0)
进口	BiocGenerics，杜比环绕声系统，seqLogo，IRanges
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	spliceSites_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	spliceSites_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	spliceSites_1.30.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/spliceSites
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/spliceSites
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/spliceSites/
软件包下载报告	下载数据