IrisSpatialFeatures

DOI:10.18129 / B9.bioc.IrisSpatialFeatures

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见IrisSpatialFeatures．

一种基于多幅中频图像的空间特征提取包

Bioconductor版本:3.7

IrisSpatialFeatures读取PerkinElmer inForm软件的输出，并计算各种空间统计数据。除了简单的计数外，它还可以得出每个细胞类型的平均最近邻和每个细胞类型的交互摘要配置文件。这些统计数据是通过图像获得的，包括整体的和用户定义的口罩定义的感兴趣的区域。

作者:Daniel Gusenleitner, Jason L. Weirather

维维者:Daniel Gusenleitner

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“IrisSpatialFeatures”)

文档

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PDF	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	FeatureExtraction，SingleCell，软件
版本	1.3.0
许可证	MIT +文件许可
取决于	R (> = 3.4)
进口	Rcpp(> = 0.12.7),SpatialTools，gplots，spatstat，tiff，RColorBrewer、方法、grDevices、graphics、stats、utils、data.table，ggplot2，dplyr，magrittr，宠物猫
链接	Rcpp
建议	knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	IrisSpatialFeatures_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	IrisSpatialFeatures_1.3.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	IrisSpatialFeatures_1.3.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IrisSpatialFeatures
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IrisSpatialFeatures
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/IrisSpatialFeatures/
包下载报告	下载数据