外观复制
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doi：10.18129/b9.bioc.exomecopy
从外显子测序读取深度的拷贝数变体检测
生物导体版本：版本（3.6）
从外显子组测序样品（包括未配对样品）中检测拷贝数变体（CNV）。该软件包实现了隐藏的马尔可夫模型，该模型使用位置协变量（例如背景读取深度和GC包含），以同时将样本正常化并分段到恒定副本计数的区域中。
作者：迈克尔·洛夫
维护者：迈克尔·洛夫（Michael Love）
引用（从r内，输入引用（“外观”））：
安装
要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”）bioclite（“ exomecopy”）
文档
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Browsevignettes（“ Exomecopy”）
| R脚本 | 外显子测序数据中的复制号变体检测 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 库务，，，，遗传学，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（6。5年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 依靠 | iranges（> = 2.5.27），基因组机（> = 1.23.16），rsamtools |
| 进口 | Stats4，方法，GenomeInfodB |
| 链接 | |
| 建议 | 生物弦 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | CN. -ops，，，，cnvpanelizer，，，，contibait，，，，稀有，，，，somaticccanceralterations |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | exomecopy_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | exomecopy_1.24.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | exomecopy_1.24.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/exomecopy |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/exomecopy/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
