contiBAIT

DOI:10.18129 / B9.bioc.contiBAIT

利用Strand-Seq数据改进早期构建基因组组装

Bioconductor版本:Release (3.6)

利用来自基因组被组装的生物体的多个单细胞的链遗传数据，contiBAIT可以将未桥接的contigs聚在一起形成假定的染色体，并在这些染色体中对contigs进行排序。

作者:Kieran O'Neill, Mark Hills, Mike Gottlieb

维护者:Kieran O'Neill

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PDF	R脚本	flowBi
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays，遗传学，GenomeAssembly，质量控制，软件，WholeGenome
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(2年)
许可证	BSD_2_clause + file LICENSE
取决于	黑洞(> = 1.51.0-3),Rsamtools(> = 1.21)
进口	grDevices,线索，集群，gplots，IRanges，GenomicRanges，S4Vectors，Rcpp，茶匙，GenomicFiles，gtools，rtracklayer，BiocParallel，DNAcopy，色彩，reshape2，ggplot2、方法、exomeCopy，GenomicAlignments，图
链接	Rcpp，黑洞
建议	BiocStyle
SystemRequirements
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包档案

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源包	contiBAIT_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	contiBAIT_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	contiBAIT_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/contiBAIT
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/contiBAIT/
软件包下载报告	下载数据