桥

DOI:10.18129 / B9.bioc.bridge

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅桥。

贝叶斯强劲的推理微分基因表达

Bioconductor版本:3.15

测试差异表达基因微阵列数据。这个包可以用于两个互补脱氧核糖核酸微阵列或Affymetrix芯片。packge适合一个健壮的贝叶斯层次模型测试的微分表达式。离群值显式地建模使用t分布美元。模型包括一个可交换的事先允许不同的方差差异的基因,但仍萎缩极端经验差异。我们的模型可以用于测试在多个样本之间的差异表达基因,并能区分不同的可能模式的微分表达式当有三个或三个以上样本。参数估计是使用马尔可夫链蒙特卡罗的小说版本时适当的模型将质量放在整个参数空间的子空间。

作者:拉斐尔Gottardo

维护人员:拉斐尔Gottardo <拉斐尔在stat.ubc.ca >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“桥”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“桥”)

PDF	R脚本	桥教程
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,微阵列,OneChannel,软件,TwoChannel
版本	1.60.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 1.9.0),罗摩
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	bridge_1.60.0.tar.gz
Windows二进制	bridge_1.60.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	bridge_1.60.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bridge
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/桥
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/bridge/
包下载报告	下载数据