trackViewer

DOI:10.18129 / B9.bioc.trackViewer

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见trackViewer．

R/Bioconductor软件包，具有web界面，可绘制优雅的交互式轨道或棒棒糖图，以促进多组学数据的综合分析

Bioconductor版本:3.12

可视化映射读取以及注释作为NGS数据集(如ChIP-seq, RNA-seq, miRNA-seq, DNA-seq, snp和甲基化数据)的跟踪层。

作者:欧建宏[aut, cre]，朱丽华[au]

维护者:欧建宏<建宏。你在duke.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("trackViewer")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“trackViewer”)

超文本标记语言	R脚本	trackViewer装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件，可视化
版本	1.26.2
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(7年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.5.0)， grDevices，GenomicRanges、网格
进口	GenomeInfoDb，GenomicAlignments，GenomicFeatures，Gviz，Rsamtools，S4Vectors，rtracklayer，BiocGenerics，尺度、工具、IRanges，AnnotationDbi，grImport，htmlwidgets，plotrix，Rgraphviz，InteractionSet，图,跑龙套
链接
建议	biomaRt，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene，RUnit，org.Hs.eg.db，BiocStyle，knitr，VariantAnnotation，httr，htmltools
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	NADfinder
建议我	ATACseqQC，ChIPpeakAnno
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	trackViewer_1.26.2.tar.gz
Windows二进制	trackViewer_1.26.2.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	trackViewer_1.26.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trackViewer
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/trackViewer
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/trackViewer/
软件包下载报告	下载数据