此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见经验丰富的人.
Bioconductor版本:3.12
stageR包允许自动分阶段分析高通量基因表达数据。该方法发表在https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-017-1277-0的《基因组生物学》杂志上
作者:Koen Van den Berge和Lieven Clement
维护者:Koen Van den Berge < Koen。Vdberge在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“经验丰富的人”)):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("stageR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“经验丰富的人”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | stageR:对R中高通量基因表达数据进行分期分析 |
| 参考手册 |
| biocViews | 软件,StatisticalMethod |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年) |
| 许可证 | GNU通用公共许可证第三版 |
| 取决于 | R (>= 3.4),SummarizedExperiment |
| 进口 | 方法,统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle、方法、Biobase,刨边机,limma,DEXSeq,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | rnaseqDTU |
| 进口我 | |
| 建议我 | MethReg |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | stageR_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | stageR_1.12.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | stageR_1.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stageR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/stageR |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/stageR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
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