简化

doi：10.18129/b9.bioc.simplifyenrichment

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅简化。

简化功能丰富结果

生物导体版本：3.12

提出了一种新的方法（二进制切割），以有效地将术语从语义相似性矩阵中归为组。每个集群中的GO术语摘要都通过单词云可视。

作者：Zuguang Gu

维护者：Zuguang gu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ SimplifyEnrichment”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“简化”）

html	R脚本	简化功能丰富结果
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	聚类，，，，去，，，，基因烯，，，，软件，，，，可视化
版本	1.0.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（0.5岁）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 3.6.0），生物基因， 网格
进口	Gosemsim，，，，复杂的图像（> = 2.5.4），循环，，，，getoptlong，，，，消化，，，，Tm值，，，，go.db，，，，org.hs.eg.db，，，，AnnotationDbi，，，，大满贯， 方法，线索，grdevices，图形，统计，utils，proxyc，，，，矩阵，，，，簇（> = 1.14.2）
链接
建议	尼特，，，，GGPLOT2，，，，牛仔图，，，，mclust，，，，APCLUSTER，，，，MCL，，，，dbscan，，，，Igraph，，，，栅格，，，，DynamiCtreCut，，，，测试，，，，栅格图，，，，clusterProfiler，，，，msigdbr，，，，剂量，，，，do.db，，，，Reactome.db，，，，Flexclust，，，，生物管理器
系统要求
增强
URL	https://github.com/jokergoo/simplifyenrichmenthttps://simplifyenrichment.github.io
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	SimplifyEnrichment_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制	SimplifyEnrichment_1.0.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	SimplifyEnrichment_1.0.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/simplifyenrichment
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/simplefifyenrichment
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/simplifyenrichment/
软件包下载报告	下载统计