seqbias

DOI:10.18129 / B9.bioc.seqbias

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见seqbias．

高通量测序数据中每个位置偏差的估计

Bioconductor版本:3.12

该软件包使用简单的贝叶斯网络在高通量测序数据中实现了每个位置的测序偏差模型，其结构和参数在一组对齐读取和参考基因组序列上进行训练。

作者:丹尼尔·琼斯

维护人员:Daniel Jones

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“seqbias”)

PDF	R脚本	高通量测序数据的技术偏差评估与调整
PDF		参考手册

细节

biocViews	测序，软件
版本	1.38.0
在Bioconductor公司	BioC 2.8 (R-2.13)(10年)
许可证	LGPL-3
取决于	R (>= 3.0.2)，GenomicRanges(> = 0.1.0),Biostrings(>= 2.15.0)，方法
进口
链接	Rhtslib(> = 1.15.3)
建议	Rsamtools，ggplot2
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
全靠我	ReQON
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	seqbias_1.38.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	seqbias_1.38.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqbias
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/seqbias
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/seqbias/
软件包下载报告	下载数据