多人

doi：10.18129/b9.bioc.multigsea

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅多人。

将基于GSEA的途径富集与多轨迹数据集成相结合

生物导体版本：3.12

可以在转录组，蛋白质组学和/或代谢组水平上使用从8个不同数据库（KEGG，Reactome，Biocarta等）得出的途径提取的特征来计算基于GSEA的组合富集评分。

作者：Sebastian Canzler [AUT，CRE]，JörgHackermüller[aut]

维护者：塞巴斯蒂安·坎兹勒（Sebastian Canzler）<塞巴斯蒂安（Sebastian）。

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ multigsea”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Multigsea”）

html	R脚本	Multigsea.html
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	生物卡尔塔，，，，基因烯，，，，途径，，，，Reactome，，，，软件
版本	1.0.2
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（0.5岁）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.0.0）
进口	马格里特，，，，石墨，，，，AnnotationDbi，，，，dplyr，，，，fgsea，，，，代码，，，，Rappdirs，，，，rlang， 方法
链接
建议	org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db，，，，org.rn.eg.db，，，，org.ss.eg.db，，，，org.bt.eg.db，，，，org.ce.eg.db，，，，org.dm.eg.db，，，，org.dr.eg.db，，，，org.gg.eg.db，，，，org.xl.eg.db，，，，org.cf.eg.db，，，，代谢物图，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，测试（> = 2.1.0）
系统要求
增强
URL	https://github.com/yigbt/multigsea
BugReports	https://github.com/yigbt/multigsea/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Multigsea_1.0.2.2.tar.gz
Windows二进制	multigsea_1.0.2.2.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Multigsea_1.0.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multigsea
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/multigsea
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/multigsea/
软件包下载报告	下载统计