此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见miRBaseConverter.
Bioconductor版本:3.12
一个全面的工具转换和检索miRNA的名称,接入,序列,版本,历史和家族信息在不同的miRBase版本。它可以在短时间内处理大量的mirna,而不需要其他依赖。
作者:Taosheng徐< Taosheng。在gmail.com x >,Thuc Le
维护人员:徐Taosheng < Taosheng。在gmail.com x >
引用(从R中,输入引用(“miRBaseConverter”)):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("miRBaseConverter")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“miRBaseConverter”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | miRBaseConverter:一个全面、高效的工具,用于转换和检索不同miRBase版本的miRNAs的信息 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
| biocViews | 软件,microrna的 |
| 版本 | 1.14.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | 统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocGenerics,RUnit,knitr,rtracklayer,跑龙套 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/taoshengxu/miRBaseConverter |
| BugReports | https://github.com/taoshengxu/miRBaseConverter/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | miRBaseConverter_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | miRBaseConverter_1.14.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | miRBaseConverter_1.14.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRBaseConverter |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRBaseConverter |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/miRBaseConverter/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
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