contiBAIT

DOI:10.18129 / B9.bioc.contiBAIT

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见contiBAIT．

利用Strand-Seq数据改进早期构建基因组组装

Bioconductor版本:3.12

利用来自生物体的多个单细胞的链遗传数据，contiBAIT可以将未连接的contigs聚在一起，形成假定的染色体，并将这些染色体中的contigs排序。

作者:基兰·奥尼尔，马克·希尔斯，迈克·戈特利布

维护者:Kieran O'Neill

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" contbait ")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“contiBAIT”)

PDF	R脚本	flowBi
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays，遗传学，GenomeAssembly，ImmunoOncology，质量控制，软件，WholeGenome
版本	1.18.0
在Bioconductor公司	BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证	bsd_clause +文件许可证
取决于	黑洞(> = 1.51.0-3),Rsamtools(> = 1.21)
进口	data.tablegrDevices,线索，集群，gplots，BiocGenerics(> = 0.31.6),S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，Rcpp，茶匙，GenomicFiles，gtools，rtracklayer，BiocParallel，DNAcopy，色彩，reshape2，ggplot2、方法、exomeCopy，GenomicAlignments，图
链接	Rcpp，黑洞
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	contiBAIT_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	contiBAIT_1.18.0.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	contiBAIT_1.18.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/contiBAIT
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/contiBAIT
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/contiBAIT/
软件包下载报告	下载数据