chromDraw

DOI:10.18129 / B9.bioc.chromDraw

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见chromDraw．

chromDraw是一个R包，用于以线性和圆形方式绘制核型方案。

Bioconductor版本:3.12

ChromDraw是一个R包，用于以线性和圆形方式绘制核型方案。可以看到染色体上的细胞遗传学膜。该工具有自己的输入数据格式。输入数据可以从GenomicRanges数据结构中导入。这个包可以以BED文件格式可视化数据。下面是对BED格式的前九个字段的要求。输出文件格式为*。Eps和*.svg。

作者:Jan Janecka, Ing。,经理马萨里克大学

维护者:Jan Janecka < Jan。Janecka在ceitec.muni.cz>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("chromDraw")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“chromDraw”)

PDF	R脚本	chromDraw
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件
版本	2.20.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(6年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.0.0)
进口	Rcpp(> = 0.11.1),GenomicRanges(> = 1.17.46)
链接	Rcpp
建议
SystemRequirements	Rtools (>= 3.1)
增强了
URL	www.plantcytogenomics.org/chromDraw
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	chromDraw_2.20.0.tar.gz
Windows二进制	chromDraw_2.20.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	chromDraw_2.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chromDraw
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/chromDraw
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/chromDraw/
软件包下载报告	下载数据