该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅Chimeraviz。
生物导体版本:3.12
Chimeraviz从融合基因发现器中管理数据,并提供有用的可视化工具。
作者:StianLågstad[Aut,Cre],Sen Zhao [CTB],Andreas M. Hoff [CTB],Bjarne Johannessen [CTB],Ole ChristianLingjærde[CTB],Rolf Skotheim [CTB] [CTB]
维护者:stianLågstad
引用(从r内,输入引用(“ Chimeraviz”)):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ chimeraviz”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Chimeraviz”)
| html | R脚本 | Chimeraviz |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
| 生物浏览 | 结盟,,,,基础设施,,,,软件 |
| 版本 | 1.16.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(4年) |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | 生物弦,,,,基因组机,,,,iranges,,,,GVIZ,,,,S4VECTORS,,,,Ensembldb,,,,AnnotationFilter,,,,Data.Table |
| 进口 | 方法,网格,rsamtools,,,,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,rcolorbrewer,图形,AnnotationDbi,,,,rcircos,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,rmarkDown,,,,图形,,,,rgraphviz,,,,DT,,,,plyr,,,,dplyr,,,,生物使用,参数检查,gtools,,,,魔术 |
| 链接 | |
| 建议 | 测试,,,,roxygen2,,,,DevTools,,,,尼特,,,,林特 |
| 系统要求 | 某些功能需要Bowtie,Samtools和Egrep |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/stianlagstad/chimeraviz |
| BugReports | https://github.com/stianlagstad/chimeraviz/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Chimeraviz_1.16.1.tar.gz |
| Windows二进制 | Chimeraviz_1.16.1.zip |
| MacOS 10.13(高山脉) | Chimeraviz_1.16.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimeraviz |
| 源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/chimeraviz |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/chimeraviz/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
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