bnbc

DOI:10.18129 / B9.bioc.bnbc

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见bnbc

Hi-C数据的带向归一化和批量校正

Bioconductor版本:3.12

用于规范化来自复制的(几个)Hi-C数据的工具。

作者:Kipper Fletez-Brant [cre, aut], Kasper Daniel Hansen [aut]

维护:Kipper Fletez-Brant

引用(从R中,输入引用(“bnbc”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“bnbc”)

超文本标记语言 R脚本 bnbc用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 归一化预处理软件
版本 1.12.0
在Bioconductor公司 BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(>= 3.5.0),方法,BiocGenericsSummarizedExperimentGenomicRanges
进口 Rcpp(> = 0.12.12),IRangesrhdf5data.tableGenomeInfoDbS4VectorsmatrixStatspreprocessCore股东价值分析平行,EBImage,跑龙套
链接 Rcpp
建议 BiocStyleknitrrmarkdownRUnit
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/hansenlab/bnbc
BugReports https://github.com/hansenlab/bnbc/issues
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 bnbc_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 bnbc_1.12.0.zip(32- & 64位)
macOS 10.13 (High Sierra) bnbc_1.12.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bnbc
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/bnbc
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/bnbc/
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