TCseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.TCseq

此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见TCseq．

时间历程测序数据分析

Bioconductor版本:3.12

表观基因组和转录组时间过程测序数据的定量和差异分析，时间过程数据的时间模式的聚类分析和可视化。

作者:吴孟军，顾磊<雷谷在broadinstitute.org>

维护者:Mengjun Wu

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“TCseq”)

PDF	R脚本	TCseq装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq，聚类，DifferentialExpression，表观遗传学，RNASeq，测序，软件，TimeCourse，可视化
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4)
进口	刨边机，BiocGenerics，reshape2，GenomicRanges，IRanges，SummarizedExperiment，GenomicAlignments，Rsamtools，e1071，集群，ggplot2，网格，grDevices, stats, utils，方法，locfit
链接
建议	testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	TCseq_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	TCseq_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	TCseq_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TCseq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TCseq
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TCseq/
包下载报告	下载数据