Singlecellexperiment

doi：10.18129/b9.bioc.singlecellexperiment

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅Singlecellexperiment。

单元数据的S4类

生物导体版本：3.12

定义用于从单细胞实验存储数据的S4类。这包括用于存储和检索每个细胞的峰值信息的专门方法，降低降低坐标和尺寸因子以及基因和库的通常元数据。

作者：Aaron Lun [AUT，CPH]，Davide Risso [AUT，CRE，CPH]，Keegan Korthauer [CTB]，Kevin Rue-Albrecht [CTB]

维护者：davide risso

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ singlecellexperiment”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Singlecellexperiment”）

html	R脚本	1. Singlecellexperiment课程的介绍
html	R脚本	2.围绕单圈体验班的发展
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DataImport，，，，datarepresentation，，，，免疫学，，，，基础设施，，，，Singlecell，，，，软件
版本	1.12.0
在生物导体中	Bioc 3.6（R-3.4）（3.5岁）
执照	GPL-3
要看	总结性特征
进口	方法，utils，stats，S4VECTORS，，，，生物基因
链接
建议	测试，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，矩阵，，，，scrnaseq，，，，RTSNE
系统要求
增强
URL
取决于我	基本，，，，Batchelor，，，，BAYESSPACE，，，，催化剂，，，，蜂窝架，，，，蜂窝轨道，，，，切塔，，，，簇发酵，，，，Cydar，，，，Cytomapper，，，，液滴，，，，实验值，，，，HCADATA，，，，我明白，，，，loomexpermiment，，，，桅杆，，，，MousegastrulationData，，，，muscdata，，，，缩放，，，，评分，，，，Scdataviz，，，，SCGPS，，，，Schex，，，，scpipe，，，，斯克兰，，，，scrnaseq，，，，砍伐，，，，Singlecelltk，，，，西班牙猎狗，，，，Spatiaxlexperiment，，，，空间Libd，，，，飞溅，，，，switchde，，，，tenxbraindata，，，，tenxpbmcdata，，，，tidysinglecellexperiment，，，，tmexplorer，，，，树木化的特殊性，，，，Zinbwave
进口我	atimpute，，，，骨料，，，，Baynorm，，，，BEARSCC，，，，ccfindr，，，，塞尔达，，，，细胞混蛋，，，，染色体，，，，Citefuse，，，，clustifyr，，，，COGAPS，，，，畜栏，，，，命运，，，，清楚的，，，，Dittoseq，，，，逃脱，，，，FCOEX，，，，hcamatrixbrowser，，，，河马，，，，伊洛格，，，，校正，，，，iseeu，，，，谱系，，，，mbkmeans，，，，metaneighbor，，，，马斯喀特，，，，星云，，，，NetSmooth，，，，新浪潮，，，，佩科，，，，Phemd，，，，管道，，，，SC3，，，，SCBFA，，，，SCCB2，，，，scdblfinder，，，，SCDD，，，，SCDS，，，，Schot，，，，scmap，，，，Scmerge，，，，scnorm，，，，SCP，，，，屏幕，，，，颈背，，，，scry，，，，sctensor，，，，sctgif，，，，Singlecellmultimodal，，，，激流回旋，，，，弹弓，，，，spsimseq，，，，Tradeseq，，，，TSCAN，，，，Velociraptor，，，，waddr，，，，Zellkonverter
建议我	窖藏，，，，desingle，，，，多萝西娅，，，，DuoClustering2018，，，，FCBF，，，，鱼池，，，，M3Drop，，，，MOFA2，，，，Ontoproc，，，，苯酚，，，，后代，，，，PubScore，，，，qfeatures，，，，scfeaturefilter，，，，SCPCA，，，，滚动，，，，Simplesinglecell，，，，辛格，，，，Tabulamurisdata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	singlecellexperiment_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	singlecellexperiment_1.12.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	singlecellexperiment_1.12.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singlecellexperiment
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/singlecellexperiment
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/singlecellexperiment/
软件包下载报告	下载统计