OmnipathR

DOI:10.18129 / B9.bioc.OmnipathR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见OmnipathR．

OmniPath web服务客户端

Bioconductor版本:3.12

OmniPath web服务的客户端(https://www.omnipathdb.org)。它还包括转换和漂亮打印一些下载数据的函数。

作者:Alberto Valdeolivas [aut]， Denes Turei [cre, aut]，阿提拉·加博尔[au]

维护者:Denes Turei

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“OmnipathR”)

超文本标记语言	R脚本	利用OmnipathR建立围绕药物靶点的蛋白质网络
超文本标记语言	R脚本	OmnipathR:在R中使用OmniPath的实用函数
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，GeneRegulation，GeneSignaling，GraphAndNetwork，网络，通路，软件，SystemsBiology，ThirdPartyClient
版本	2.0.0
在Bioconductor	BioC 3.10 (R-3.6)(1.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 4.0)，igraph，图形，方法，utils，jsonlite
进口	dplyr统计数据,rlang，tidyr
链接
建议	dnet，gprofiler2，BiocStyle，testthat，knitr，rmarkdown，ggplot2，ggraph
SystemRequirements
增强了
URL	https://saezlab.github.io/OmnipathR/
BugReports	https://github.com/saezlab/OmnipathR/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	OmnipathR_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	OmnipathR_2.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	OmnipathR_2.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OmnipathR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/OmnipathR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/OmnipathR/
软件包下载报告	下载数据