此包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GeneStructureTools.
Bioconductor版本:3.12
GeneStructureTools可用于在硅片中创建替代剪接事件,并分析这对功能基因产物的潜在影响。
作者:贝丝信号
维护器:贝丝信号
引用(从R中,输入引用(“GeneStructureTools”)):
要安装此包,启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GeneStructureTools")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“GeneStructureTools”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 介绍GeneStructureTools |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
| biocViews | AlternativeSplicing,DifferentialSplicing,FunctionalPrediction,ImmunoOncology,RNASeq,软件,转录组 |
| 版本 | 1.10.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (R-3.5)(3年) |
| 许可证 | BSD_3_clause +文件许可证 |
| 取决于 | |
| 进口 | Biostrings,GenomicRanges,IRanges,data.table,plyr,stringdist,stringr,S4Vectors,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10,统计,跑龙套,Gviz,rtracklayer、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | GeneStructureTools_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GeneStructureTools_1.10.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | GeneStructureTools_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneStructureTools |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneStructureTools |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/GeneStructureTools/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
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