GeneBreak

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneBreak

该软件包适用于Bioconductor的3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GeneBreak

基因断裂检测

Bioconductor版本:3.12

重复断点基因在拷贝数畸变谱中的检测。

作者:Evert van den Broek, Stef van Lieshout

维护者:埃弗特·范登布鲁克<范登布鲁克。everat gmail.com>

引用(来自R,输入引用(“GeneBreak”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.0")并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager",悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GeneBreak")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“GeneBreak”)

PDF R脚本 GeneBreak
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariationDNASeq遗传学测序软件可视化WholeGenomeaCGH
版本 1.20.0
在Bioconductor中 BioC 3.2 (R-3.2)(5.5岁)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.2),QDNAseqCGHcallCGHbaseGenomicRanges
进口 图形、方法
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/stefvanlieshout/GeneBreak
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 GeneBreak_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 GeneBreak_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) GeneBreak_1.20.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/GeneBreak
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/GeneBreak
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/GeneBreak/
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