此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见DNAshapeR.
Bioconductor版本:3.12
DNAhapeR是一个R/BioConductor包,用于超快速、高通量的DNA形状特征预测。该软件包允许预测,可视化和编码DNA形状特征进行统计学习。
作者:Tsu-Pei Chiu和Federico Comoglio
维护人员:Tsu-Pei Chiu
引文(从R内,输入引用(“DNAshapeR”)):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DNAshapeR")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“DNAshapeR”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | DNAshapeR |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
| biocViews | DNA3DStructure,软件,StructuralPrediction |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 3.4),GenomicRanges |
| 进口 | Rcpp(> = 0.12.1),Biostrings,字段 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | AnnotationHub,knitr,rmarkdown,testthat,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,脱字符号 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | DNAshapeR_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | DNAshapeR_1.18.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | DNAshapeR_1.18.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAshapeR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DNAshapeR |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/DNAshapeR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
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