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PGSEA
DOI:10.18129 / B9.bioc.PGSEA
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅PGSEA。
参数基因集富集分析
Bioconductor版本:3.11
参数分析的基因集富集
作者:凯尔Furge <凯尔。furge vai.org >和卡尔Dykema <卡尔。在vai.org dykema >
维护人员:卡尔Dykema <卡尔。在vai.org dykema >
从内部引用(R,回车引用(“PGSEA”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PGSEA”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“PGSEA”)
| R脚本 | HOWTO: PGSEA | |
| R脚本 | HOWTO: PGSEA工作流示例 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | 微阵列,软件 |
| 版本 | 1.61.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.0 (r - 2.5)(13.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 2.10),GO.db,KEGG.db,AnnotationDbi,annaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | GSEABase,GEOquery,org.Hs.eg.db,hgu95av2.db,limma |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | GeneExpressionSignature |
| 进口我 | |
| 建议我 | gskb |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | PGSEA_1.61.0.tar.gz |
| Windows二进制 | PGSEA_1.61.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PGSEA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PGSEA |
| 包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/PGSEA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
