scfind
doi：10.18129/b9.bioc.scfind
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅scfind。
通过基因列表的单细胞RNA-seq数据的搜索工具
生物导体版本：3.10
最近，已经生成并公开发布了大量的单细胞RNA-SEQ（SCRNA-SEQ）数据集。为了使该集合有用，必须以支持与研究人员相关的查询的方式组织信息。`scfind`从SCRNA-SEQ数据集中构建索引，该数据集以合适而紧凑的方式组织信息，以便可以非常有效地搜索数据集以表达给定基因列表的单元格或单元格类型。
作者：Vladimir Kiselev
维护者：vladimir kiselev
引用（从r内，输入引用（“ scfind”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ scfind”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ scfind”）
| html | R脚本 | `scfind`软件包小插图 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | datarepresentation，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录，，，，转录组学 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（2。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.4） |
| 进口 | Singlecellexperiment，，，，总结性特征，方法，统计，少量，，，，dplyr，，，，哈希，，，，RESHAPE2，，，，RCPP（> = 0.12.12） |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/hemberg-lab/scfind |
| BugReports | https://support.bioconductor.org/t/scfind/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | scfind_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | scfind_1.8.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | scfind_1.8.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scfind |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/scfind |
| 包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/scfind/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
