SRAP

doi:10.18129/b9.bioc.srap

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅SRAP

简化的RNA-seq分析管道

生物导体版本:3.10

该软件包提供了用于基因表达分析的管道(主要用于RNA-seq数据)。归一化函数对于RNA-seq分析是特异性的,但是所有其他功能(质量控制图,差异表达和可视化以及通过BD-FUNC的功能富集)都将与任何类型的基因表达数据一起使用。

作者:查尔斯·沃登(Charles Warden)

维护者:Charles Warden

引用(从r内,输入引用(“ SRAP”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ srap”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ srap”)

PDF R脚本 SRAP小插图
PDF 参考手册

细节

生物浏览 差异性,,,,,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,软件,,,,统计数据,,,,可视化
版本 1.26.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(6。5年)
执照 GPL-3
要看 writexls
进口 GPLOTS,,,,,,,,rocr,,,,QVALUE
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 srap_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 srap_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) srap_1.26.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/srap
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/srap
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/srap/
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