netReg

DOI:10.18129 / B9.bioc.netReg

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见netReg

网络正则化回归模型

Bioconductor版本:3.10

netReg使用网络惩罚拟合线性回归模型。图先验知识,以生物网络的形式,被纳入线性模型的损失函数。这些网络描述了生物关系,如共同调节或依赖相同的转录因子/代谢物等。给出了系数型曲线的部分稀疏部分光滑解。

作者:Simon Dirmeier [aut, re]

维护者:Simon Dirmeier < Simon。dimeier在web.de b>

引文(从R内,输入引用(“netReg”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager",悄然= TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("netReg")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“netReg”)

超文本标记语言 R脚本 netReg
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews FeatureExtractionGraphAndNetwork网络回归软件StatisticalMethod
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(3年)
许可证 GPL-3 | BSL-1.0 +文件许可证
取决于 R (>= 3.4)
进口 Rcpp,统计数据
链接 RcppRcppArmadillo
建议 testthatknitrrmarkdownBiocStylelintrlassoshooting
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL https://github.com/dirmeier/netReg
BugReports https://github.com/dirmeier/netReg/issues
全靠我
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建议我
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 netReg_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 netReg_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) netReg_1.10.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/netReg
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/netReg
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/netReg/
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