Geecc.

DOI：10.18129 / b9.bioc.geecc

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅Geecc.。

基因设定富集分析扩展到应急立方体

生物导体版本：3.10

使用Log-Linear模型对两种（基于应急表）或三类（应急立方体）来执行Gene的超细和Chi Squared测试。类别可以是差异表达的基因，GO术语，序列长度，GC含量，染色体位置，Phylostrata，分层，......

作者：Markus Boenn

维护者：Markus Boenn

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“geecc”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

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PDF.	r script.	GEECC用户指南
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	生物动合那去那基因表达那GenesetenRichment.那免疫学那微阵列那rnaseq.那软件那统计方法那转录那WorkflowStep.
版本	1.20.0
在生物导体中以来	BIOC 3.0（R-3.1）（5.5岁）
执照	GPL（> = 2）
依靠	R（> = 3.3.0），方法
进口	大量的那hexcegea.（> = 1.3.0），贡献那rcpp.（> = 0.11.3），图形，统计数据，util
链接到	rcpp.
建议	hgu133plus2.db.那go.db.那annotationdbi.
系统要求	rcpp.
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	geecc_1.20.0.tar.gz.
Windows二进制文件	geecc_1.20.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	geecc_1.20.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/geecc.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ geecc
包短网址	https://biocumon.org/packages/geecc/
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