IPPD

DOI:10.18129 / B9.bioc.IPPD

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见IPPD

模板匹配蛋白质质谱的同位素峰模式反褶积

Bioconductor版本:3.10

该软件包提供了从原始质谱中提取同位素峰模式的功能。这是通过使用非负最小二乘或最小绝对偏差拟合将大量模板基函数拟合到原始频谱来完成的。该软件包提供了一个灵活的功能,试图以一种适合数据中的峰值形状的方式估计模型参数。该包还提供了处理LCMS运行的功能。

作者:Martin Slawski , Rene Hussong < Rene。胡松在大学。lu>, Andreas Hildebrandt < Andreas。hildebrandt at uni-mainz.de>, Matthias Hein < Hein at cs.uni-saarland.de>

维护者:Martin slowski

引文(从R内,输入引用(“IPPD”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("IPPD")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“IPPD”)

PDF R脚本 IPPD手册
PDF 参考手册

细节

biocViews 蛋白质组学软件
版本 1.34.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(9年)
许可证 GPL(版本2或更高版本)
取决于 R (>= 2.12.0),质量矩阵XML消化bitops
进口 方法,统计数据,图形
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我 RforProteomics
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 IPPD_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 IPPD_1.34.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) IPPD_1.34.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IPPD
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/IPPD
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/IPPD/
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