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此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见exomeCopy．

从外显子组测序读取深度检测拷贝数变异

Bioconductor版本:2.12

检测拷贝数变异(CNV)从外显子组测序样本，包括未配对的样本。该包实现了一个隐马尔可夫模型，该模型使用位置协变量，如背景读取深度和GC-content，同时将样本归一化并分割为常量拷贝计数的区域。

作者:迈克尔·洛夫

维护者:Michael Love

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.andersvercelli.com/biocLite.R”)biocLite(“exomeCopy”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“exomeCopy”)

PDF	R脚本	外显子组测序数据中的拷贝数变异检测
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariants，遗传学，HighThroughputSequencing，测序，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	IRanges，GenomicRanges，Rsamtools
进口	stats4、方法
链接
建议	Biostrings
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	exomeCopy_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	exomeCopy_1.6.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	exomeCopy_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/exomeCopy/tree/release-2.12
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/exomeCopy/
软件包下载报告	下载数据