经验丰富的人

DOI:10.18129 / B9.bioc.stageR

演员:级间的高通量基因表达数据分析R

Bioconductor版本:版本(3.17)

经验丰富的人包允许自动化级间高通量基因表达数据的分析。该方法在https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059发表在《基因组生物学- 017 - 1277 - 0

作者:柯恩Van den Berge和列文克莱门特

维修工:柯恩Van den Berge <柯恩。在gmail.com vdberge >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“经验丰富的人”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes(“经验丰富的人”)

HTML	R脚本	演员:R级间高通量基因表达数据的分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件,StatisticalMethod
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	GNU通用公共授权版本3
取决于	R (> = 3.4),SummarizedExperiment
进口	方法,统计数据
链接
建议	knitr rmarkdown,BiocStyle、方法、Biobase,刨边机,limma,DEXSeq,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	rnaseqDTU
进口我
建议我	MethReg,土星
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	stageR_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	stageR_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	stageR_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	stageR_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stageR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/经验丰富的人
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/stageR/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/stageR/
包下载报告	下载数据