咆哮

DOI:10.18129 / B9.bioc.roar

从RNA-seq比对确定微分APA使用

Bioconductor版本:版本(3.17)

确定优先使用APA网站,比较两个生物条件,从已知的替代标准RNA-seq试验得到网站和比对。

作者:埃琳娜格拉希

维护人员:埃琳娜·葛拉<葛。在gmail.com e >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“咆哮”)

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PDF	R脚本	从RNA-seq比对确定微分APA使用
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细节

biocViews	HighThroughputSequencing,RNAseq,测序,软件,转录
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(9年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.0.1)
进口	方法,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,SummarizedExperiment,GenomicAlignments(> = 0.99.4),rtracklayer,GenomeInfoDb
链接
建议	RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/vodkatad/roar/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	roar_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	roar_1.36.0.zip
macOS二进制(x86_64)	roar_1.36.0.tgz
macOS二进制(arm64)	roar_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/roar
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/咆哮
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/roar/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/roar/
包下载报告	下载数据