rBiopaxParser

DOI:10.18129 / B9.bioc.rBiopaxParser

解析BioPax文件和在R代表他们

Bioconductor版本:版本(3.17)

解析BioPAX文件和代表在R,此刻BioPAX 2级和3级支持。

作者:弗兰克·克莱默

维护人员:弗兰克·克雷默< frank.kramer在informatik.uni-augsburg.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rBiopaxParser”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rBiopaxParser”)

PDF	R脚本	rBiopaxParser装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation,软件
版本	2.40.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(10年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 4.0), data.table
进口	XML
链接
建议	RgraphvizRCurl,图RUnit,BiocGenerics,RBGL,igraph
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/frankkramer-lab/rBiopaxParser
取决于我
进口我	pwOmics
建议我	AnnotationHub,NetPathMiner
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	rBiopaxParser_2.40.0.tar.gz
Windows二进制	rBiopaxParser_2.40.0.zip
macOS二进制(x86_64)	rBiopaxParser_2.40.0.tgz
macOS二进制(arm64)	rBiopaxParser_2.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rBiopaxParser
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rBiopaxParser
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/rBiopaxParser/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rBiopaxParser/
包下载报告	下载数据