pathVar

DOI:10.18129 / B9.bioc.pathVar

方法找到通路变化明显不同

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包包含函数来找到途径有明显不同的变化比参考基因集。它也发现了重要的类别从这个通道,每个类别是一个集群的基因。基因分为集群级别的可变性。

作者:劳伦斯·德多浪迪警官,塞缪尔·齐默尔曼,杰西卡Mar

维护人员:塞缪尔·齐默尔曼< samuel.e。齐默尔曼在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“pathVar”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pathVar”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF R脚本 教程在如何使用函数\ texttt {PathVar}包
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细节

biocViews GeneSetEnrichment,GeneticVariability,通路,软件
版本 1.30.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(7.5年)
许可证 LGPL (> = 2.0)
取决于 R(> = 3.3.0)、方法ggplot2 gridExtra
进口 EMT mclust,匹配,数据。表、统计grDevices、图形跑龙套
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 pathVar_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 pathVar_1.30.0.zip
macOS二进制(x86_64) pathVar_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) pathVar_1.29.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathVar
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pathVar
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/pathVar/
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/pathVar/
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