nuCpos

DOI:10.18129 / B9.bioc.nuCpos

预测的R包核小体的位置

Bioconductor版本:版本(3.17)

nuCpos NuPoP的衍生物,是预测的R包核小体的位置。nuCpos计算局部和整体nucleosomal组蛋白亲和力(HBA)成绩147 -英国石油(bp)对于一个给定的序列。注意:这个包是为了演示使用化学地图预测。作为父母的包NuPoP现在提供chemical-map-based预测,dHMM-based预测的功能从这个包。nuCpos继续提供HBA计算功能。

作者:总裁中西宏明加藤,武铀源

维护人员:总裁中西宏明加藤< hkato在med.shimane-u.ac.jp >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“nuCpos”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“nuCpos”)

PDF	R脚本	R包核小体定位的预测
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	表观遗传学,遗传学,NucleosomePositioning,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	图形、方法
链接
建议	NuPoP,Biostrings,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	nuCpos_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	nuCpos_1.18.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	nuCpos_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64)	nuCpos_1.17.4.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nuCpos
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ nuCpos
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/nuCpos/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/nuCpos/
包下载报告	下载数据