Bioconductor版本:版本(3.17)
epiNEM是最初的嵌套的延伸效应模型(NEM)。EpiNEM能够考虑淘汰赛和推断出更复杂的网络信号通路的两倍。它是专门针对大型双淘汰赛屏幕。
作者:&马丁Pirkl玛德琳迪克曼
维护人员:马丁Pirkl < martinpirkl在yahoo.de >
从内部引用(R,回车引用(“epiNEM”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“epiNEM”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“epiNEM”)
HTML | R脚本 | epiNEM |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 网络,NetworkInference,通路,软件,SystemsBiology |
版本 | 1.24.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(6年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 4.1) |
进口 | BoolNet、e1071 gtools,统计、igraph跑龙套,晶格,latticeExtra, RColorBrewer, pcalg,minetgrDevices,图,mnem,latex2exp |
链接 | |
建议 | RUnit knitr,BiocGenerics,STRINGdbdevtools rmarkdown,GOSemSim,AnnotationHub,org.Sc.sgd.db,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/ |
BugReports | https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/issues |
取决于我 | |
进口我 | bnem,dce,nempi |
建议我 | mnem |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。
源包 | epiNEM_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | epiNEM_1.24.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | epiNEM_1.24.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | epiNEM_1.24.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epiNEM |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epiNEM |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/epiNEM/ |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/epiNEM/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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