epiNEM

DOI:10.18129 / B9.bioc.epiNEM

epiNEM

Bioconductor版本:版本(3.17)

epiNEM是最初的嵌套的延伸效应模型(NEM)。EpiNEM能够考虑淘汰赛和推断出更复杂的网络信号通路的两倍。它是专门针对大型双淘汰赛屏幕。

作者:&马丁Pirkl玛德琳迪克曼

维护人员:马丁Pirkl < martinpirkl在yahoo.de >

从内部引用(R,回车引用(“epiNEM”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“epiNEM”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML R脚本 epiNEM
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 网络,NetworkInference,通路,软件,SystemsBiology
版本 1.24.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 4.1)
进口 BoolNet、e1071 gtools,统计、igraph跑龙套,晶格,latticeExtra, RColorBrewer, pcalg,minetgrDevices,,mnem,latex2exp
链接
建议 RUnit knitr,BiocGenerics,STRINGdbdevtools rmarkdown,GOSemSim,AnnotationHub,org.Sc.sgd.db,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/
BugReports https://github.com/cbg-ethz/epiNEM/issues
取决于我
进口我 bnem,dce,nempi
建议我 mnem
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包 epiNEM_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 epiNEM_1.24.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) epiNEM_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) epiNEM_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/epiNEM
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ epiNEM
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/epiNEM/
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/epiNEM/
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