adductomicsR

DOI:10.18129 / B9.bioc.adductomicsR

adductomic质量光谱数据集的处理

Bioconductor版本:版本(3.17)

流程一份数据来识别潜在的加合物肽从光谱已经纠正了大规模漂移和保留时间漂移和量化MS1质量光谱的峰值水平。

作者:乔西海耶斯< jlhayes1982 gmail.com >

维修工:乔西海耶斯< jlhayes1982 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“adductomicsR”)

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文档

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HTML	R脚本	Adductomics工作流
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,GUI,MassSpectrometry,代谢组学,软件,ThirdPartyClient
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6),adductData,ExperimentHub,AnnotationHub
进口	平行(> = 3.3.2)数据。表(> = 1.10.4)OrgMassSpecR (> = 0.4.6), foreach (> = 3),mzR(> = 2.14.0)ade4(> = 1.7.6),房车(> = 0.3.2)pastecs (> = 1.3.18) reshape2 (> = 1.4.2) pracma (> = 2.0.4), DT (> = 0.2), fpc (> = 2.1.10) doSNOW (> = 1.0.14) fastcluster (> = 1.1.22) RcppEigen(> = 0.3.3.3.0),引导(> = 2017.2),平滑(> = 1.1),dplyr(> = 0.7.5),动物园(> = 1.8),数据(> = 3.5.0),跑龙套(> = 3.5.0),图形(> = 3.5.0),grDevices(> = 3.5.0)、方法(> = 3.5.0),数据集(> = 3.5.0)
链接
建议	knitr (> = 1.15.1) rmarkdown (> = 1.5),Rdisop(> = 1.34.0),testthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/JosieLHayes/adductomicsR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	adductomicsR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	adductomicsR_1.16.0.zip
macOS二进制(x86_64)	adductomicsR_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64)	adductomicsR_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/adductomicsR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ adductomicsR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/adductomicsR/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/adductomicsR/
包下载报告	下载数据