TMixClust

DOI:10.18129 / B9.bioc.TMixClust

时间序列聚类的基因表达与高斯Mixed-Effects模型和平滑样条函数

Bioconductor版本:版本(3.17)

实现时间序列基因表达数据的聚类方法基于mixed-effects模型和高斯变量和非参数三次样条函数估计。该方法可以强劲占高水平的噪音在典型的基因表达时间序列数据集。

作者:莫妮卡Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡:gmail.com >

维护人员:莫尼卡Golumbeanu < Golumbeanu。莫妮卡:gmail.com >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TMixClust”)

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PDF	R脚本	与TMixClust聚类时间序列基因表达数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,GeneExpression,软件,StatisticalMethod,TimeCourse
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4)
进口	gss, mvtnorm统计,动物园,集群,跑龙套,BiocParallelflexclust grDevices,图形,Biobase,SPEM
链接
建议	rmarkdown knitr,BiocStyle,testthat
SystemRequirements
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构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	TMixClust_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	TMixClust_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	TMixClust_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	TMixClust_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TMixClust
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TMixClust
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/TMixClust/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TMixClust/
包下载报告	下载数据