TFARM

DOI:10.18129 / B9.bioc.TFARM

转录因子关联规则

Bioconductor版本:版本(3.17)

它搜索相关协会的转录因子,转录因子的目标,在特定基因组区域。它还允许评估的重要性指数分布转录因子和转录因子的组合关联规则。

作者:Liuba娜乌西卡马蒂诺,爱丽丝Parodi,盖亚Ceddia, Piercesare西奇,斯特凡诺Campaner,马可Masseroli

维护人员:Liuba娜乌西卡马蒂诺< liuban。马蒂诺在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“TFARM”)

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文档

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PDF	R脚本	转录因子关联规则
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文本		新闻

细节

biocViews	BiologicalQuestion,基础设施,软件,StatisticalMethod,转录
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	arules、字段GenomicRanges、图形、stringr方法、统计gplots
链接
建议	BiocStyle、knitr plyr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	TFARM_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	TFARM_1.22.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	TFARM_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	TFARM_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TFARM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TFARM
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/TFARM/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/TFARM/
包下载报告	下载数据