SWATH2stats

DOI:10.18129 / B9.bioc.SWATH2stats

转换和过滤片数据统计软件包

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包是为了片OpenSWATH软件的数据转换成可读的格式由其他统计软件包在执行过滤、注释和罗斯福评估。

作者:彼得Blattmann (aut (cre)莫里茨Heusel (aut) Ruedi Aebersold (aut)

维护人员:彼得Blattmann < peter_blattmann在bluewin.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SWATH2stats”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SWATH2stats”)

PDF	R脚本	SWATH2stats示例脚本
PDF	R脚本	SWATH2stats包装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,ExperimentalDesign,ImmunoOncology,MassSpectrometry,预处理,蛋白质组学,软件
版本	1.30.1
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(8年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10.0)
进口	数据。统计数据,表、reshape2 ggplot2 grDevices,图形,跑龙套,biomaRt、方法
链接
建议	testthat、knitr rmarkdown
SystemRequirements
增强了	MSstats,PECA,aLFQ
URL	https://peterblattmann.github.io/SWATH2stats/
BugReports	https://github.com/peterblattmann/SWATH2stats
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	SWATH2stats_1.30.1.tar.gz
Windows二进制	SWATH2stats_1.30.1.zip
macOS二进制(x86_64)	SWATH2stats_1.30.1.tgz
macOS二进制(arm64)	SWATH2stats_1.29.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SWATH2stats
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SWATH2stats
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SWATH2stats/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SWATH2stats/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.17源码包	源存档