SEPIRA

DOI:10.18129 / B9.bioc.SEPIRA

系统表观基因组学推理的监管活动

Bioconductor版本:版本(3.17)

SEPIRA(系统监管活动的表观基因组学推理)是一种算法,推断sample-specific转录因子的活动从全基因组表达或DNA甲基化的样本。

作者:个陈(aut (cre),安德鲁Teschendorff (aut)

维护人员:个陈< cytwarmmay hotmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SEPIRA”)

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文档

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HTML	R脚本	介绍“SEPIRA”
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文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneRegulation,GeneTarget,网络,NetworkInference,软件,转录
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5.0)
进口	limma(> = 3.32.5)corpcor(> = 1.6.9),并行(> = 3.3.1),统计数据
链接
建议	knitr、rmarkdown testthat igraph
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	SEPIRA_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	SEPIRA_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64)	SEPIRA_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64)	SEPIRA_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SEPIRA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SEPIRA
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SEPIRA/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SEPIRA/
包下载报告	下载数据