SCnorm

DOI:10.18129 / B9.bioc.SCnorm

单细胞RNA-seq数据的标准化

Bioconductor版本:版本(3.17)

这个包实现SCnorm——方法规范化单细胞RNA-seq数据。

作者:朗达巴彻

维护人员:朗达巴彻< rbacher ufl.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SCnorm”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SCnorm”)

PDF	R脚本	SCnorm装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology,归一化,RNASeq,SingleCell,软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	SingleCellExperiment,SummarizedExperiment、数据、方法、图形、grDevices平行,quantreg,集群,时刻,data.table,BiocParallel,S4Vectorsggplot2 forcats,BiocGenerics
链接
建议	BiocStyle,rmarkdown knitr devtools
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/rhondabacher/SCnorm
BugReports	https://github.com/rhondabacher/SCnorm/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	SCnorm_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	SCnorm_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	SCnorm_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64)	SCnorm_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCnorm
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SCnorm
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SCnorm/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SCnorm/
包下载报告	下载数据