短链脂肪酸

DOI:10.18129 / B9.bioc.SCFA

因子分析SCFA:子类型化通过共识

Bioconductor版本:版本(3.17)

子类型化通过共识因子分析(SCFA)可以有效地去除噪声信号分子模式multi-omics数据一致。SCFA首先使用一个autoencoder只选择重要的特性,然后反复进行因子分析来表示数据和不同数量的因素。使用这些表示,它能够可靠地识别癌症亚型和准确地预测风险评分的患者。

作者:Duc Tran (aut (cre),挂着阮(aut),锡阮(曾经)

维护人员:Duc Tran在nevada.unr.edu <道>

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SCFA”)

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HTML	R脚本	SCFA包手册
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细节

biocViews	分类,聚类,软件,生存
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	LGPL
取决于	R (> = 4.0)
进口	matrixStats,BiocParallel火炬(> = 0.3.0)、重复、igraph,矩阵,集群,心理,glmnet, RhpcBLASctl,统计,跑龙套,方法,生存
链接
建议	knitr rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/duct317/SCFA
BugReports	https://github.com/duct317/SCFA/issues
取决于我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	SCFA_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	SCFA_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64)	SCFA_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64)	SCFA_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SCFA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SCFA
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/SCFA/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SCFA/
包下载报告	下载数据